有没有帮忙跑动力学模拟的，有偿！

现在还有朋友在用towhee进行分子动力学模拟吗？

我用matlab计算原子坐标，生成了XYZ文件，导入VMD之后，原子之间会出现乱七八糟的连线，请问是为什么？

求问各位大佬，MS如何研究溶液盒子界面处的电场强度

有大哥dai做耗散动力学的 踢我一下 在线等

用MS画好了溶液，导入VMD中，结果也不是方形盒子，也乱成键

根据径向分布函数怎么求配位数呢，哪位大佬帮帮小白，是径向分布函数曲线与坐标轴围成的面积吗，直接积分对吗

LAMMPS与分子动力学专项研究群：681058022，可以一起交流学习

有大神给讲讲不？

gromacs-amber-namd-lammps-ms等

分子动力学交流群：776763109

MS可以用来求固液界面润湿角吗？

急急急

在用AC建模的时候，用find pattern工具标记了键长，键角和二面角，并把它各自标记为set，但是用搭建交联结构的脚本后，却发现set消失了，请问各位大佬，这是怎么回事？如何解决呢？

LAMMPS分子动力学核心技术实战 2020年10月30日— 2020年11月02日 (线上直播) 另有VASP、Gaussian培训，有意随时联系 【咨询电话】报名联系方式： 闫灿然(老师) 手机：17777853350 电话：010-56129268 官方微信：ycrsuperman 备注：正规增值税发票，可以开具培训费、会议费、资料费 lammps分子动力学QQ群号:75326786 （加群备注：闫老师邀请）

诚心寻找精通模拟计算的合作老师，各种模拟计算软件的都需要，为实验课题组提供模拟计算，具体的计算费用根据体系或者计算周期决定，实验课题组基本上都是一些简单的模拟计算，主要是因为实验课题组时间有限，急需出成果，计算费用可以详谈，有意者可以联系微信18817275937，或者QQ1354998253。

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请问大佬们，MS软件中如何实现压缩晶胞至理论密度这一步操作啊？

本人刚刚开始接触分子动力学，刚开始学习NAMD，想知道有什么推荐的资料，可以深入学习的吗

全国高校及科研单位：为响应《国务院应对新型冠状病毒感染肺炎疫情联防联控机制》 坚决贯彻党中央、国务院决策 部署，助力打赢疫情防控阻击战 进一步提升科研工作者技能水平中国管理科学研究院职业资格认证培训中心 在疫情期间大力开展远程在线课程培训班，现将具体通知如下 课程大纲 一、LAMMPS基础 二、LAMMPS入门学习 三、LAMMPS进阶学习 四、Lammps的建模 五、从examples的简单例子，到完成自己的科研课题 六，环氧树脂在二氧化硅表面吸附建

LAMMPS分子动力学核心技术实战培训班 2020年06月18日—— 2020年06月20日 (线上直播) 2020年06月18日—— 2020年06月21日 北 京(线场) 课程目标： 1. LAMMPS分子动力学理论与软件操作培训，边讲解边实践操作。 2. 通过本课程的学习，学员熟练掌握LAMMPS分子动力学的原理、方法、软件操作。 3. 学员基本具备独立完成LAMMPS分子动力学的论文及实际科研工程的能力。 课程大纲 一、LAMMPS基础 二、LAMMPS入门学习 三、LAMMPS进阶学习 四、Lammps的建模 五、从examples的简单例

经核实吧主WinhaoL 未通过普通吧主考核。违反《百度贴吧吧主制度》第八章规定http://tieba.baidu.com/tb/system.html#cnt08 ，无法在建设 分子动力学模拟吧 内容上、言论导向上发挥应有的模范带头作用。故撤销其吧主管理权限。百度贴吧管理组

RT，我直接读取.lammpstrj文件的数据就会出错，请问下怎么样才能读取呢？

接lammps 分子动力学变形与损伤模拟 预制孪晶，孔洞，层错，位错在不同加载下研究变形; 冲击波研究，层裂，孪晶，位错演化分析 单双晶取向，温度，晶界效应 有偿，私

包括扶手椅型和锯齿形

为了交流相互学习，吧里没找到群，我就建一个吧，答疑、交流、经验分享，欢迎大神。

大家用的分子模拟哪个软件啊！我是新手

请教一下各位，我要利用NAMD进行分子动力学模拟，然后我可以从蛋白库中提取到蛋白结构。但我要模拟的结构并不是这个提取出的结构，而是以这个蛋白结构为基础单元，形成一个链状结构进行分析。因此，重新建立结构的过程可以用VMD实现吗？

急问，这个水模型的gro缺失怎么办？哪里可以下载？

请问材料学分子动力学模拟方向的博士值得读么，就业形势怎样

GROMACS分子动力学模拟技术应用培训通知 时间：2017年11月23日 —11月26日 地点：南京 电子版文件如下：需要

关于“分子动力学模拟技术与应用”专题培训班课程内容 AMBER建模 课程1 Linux基础 课程2 AMBER软件简介 课程

如题，在下研一，导师让用ms计算一种金属氧化物的物理性质，忙活了小半个月把物理性质计算出来交给老师，老师说计算的不对，我这才知道原来结构优化之前需要进行收敛性测试，，，，，毕竟隔行如隔山，我现在知道怎样进行收敛性测试了，但接下来问题又来了，请问各位大神，当收敛性测试之后，对于后面的结构优化，以及各项物理性质的计算（如弹性模量，熔点，结合能，总能等）的参数设置怎么选取？比如： 泛函的选取， 在结构优化时

有没有大神做过分子动力学模拟管道流动的？管道粗糙度怎么用lammps编写呢？

利用分子动力学模拟的方法，计算研究不同边界的石墨烯在电场作用下力学性能的变化，，，求帮忙啊，

看文献老是出现这个单词，什么意思？字典查不到

NVIDIA 推出全球最高效能的 NVIDIA Tesla K80 双 GPU 加速器，专为机器学习、资料分析、科学和高效能运算 (HPC) 等广泛应用设计，并为 NVIDIA Tesla 加速运算平台增添最新旗舰级產品。 Tesla K80 双 GPU 加速器是 Tesla 加速运算平台的全新旗舰级產品。Tesla 加速运算平台是针对大型科学探索和深入分析的顶尖运算平台，其中结合全球最快速的 GPU 加速器、业界广泛使用的 CUDA 平行运算模型以及完整的软体开发者、软体商和资料中心系统OEM的產业体系支援。 相较于前

求c程序代码：20x20的二维L-J势的MD模拟C程序 用上Velocity Verlet算法

假期结束了，明日启程回美帝，接着未完的活研究下去！